人or猪or狗的物种判断应先做数据质控



质控工具的输出应保存为独立报告。fast✨p、FastQC等工具可以帮助发现质量问题,但它们只能说明序列是否适合分析,不能直接回答样本来自人、猪还是狗。



怎样设置证据标准,避免把混合样本判成单一物种



DNA样本数据和参考基因组承担的任务不同,下载前必须先区分两者。样本数据通常来自测序项目,常见文件是FASTQ,里面保存实际测得的读段及质量值;参考基因组通常是FASTA,里面保存经过组装的染色体🔮或 contig 序列,常配❤️套GFF、GTF、索引和染色体长度文件。



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